在2009年北京市优秀博士学位论文评选中，传染病所呼吸道传染病室邵祝军的博士学位论文《ST-4821序列群C群脑膜炎奈瑟菌的发现和中国脑膜炎奈瑟菌菌株种群遗传学分析》经学科评选组评审和评选专家委员会会议评审，经北京市教委主任办公会议批准，荣获2009北京市优秀博士学位论文，这是中国疾病预防控制中心唯一一篇入选的优秀博士学位论文。

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　　北京市优秀博士学位论文的评选工作是北京高等学校科学技术与研究生教育创新工程的重要内容，旨在提高研究生培养质量，鼓励创新，促进高层次人才脱颖而出。市教委将根据《关于做好北京市优秀博士学位论文评选工作的通知》（京教研【2008】6号）的有关规定，设立专项资金支持北京市优秀博士学位论文制作者的指导教师开展新的科学研究；在北京地区高校工作的优秀博士学文论文作者，可优先获得北京高等学校科学技术与研究生教育创新工程中有关建设项目的资助.